合金装备5：原爆点 MGS百科 全系列剧情与人物编年史
《合金装备》（英文：Metal Gear Solid、日文：メタルギアソリッド、官方中文名为：潜龙谍影）是由日本科乐美（KONAMI）公司发行、小岛制作室（KOJIMA PRODUCTION）制作的著名战术谍报系列游戏。从1987年的初代游戏到目前即将发售的《合金装备 原爆点》，已经有27年历史，这样的一个时间跨度可以充分证明系列游戏的受欢迎程度和超高的素质！
《合金装备》系列的内容确实比较庞杂，无论是复杂的故事剧情还是容易混淆的人物设定，即便是系列的FANS也无法100%熟知其中的方方面面。鉴于这种情况，我制作了《合金装备》系列简史，相信看过后，大家都能对这个系列的剧情有一些简单的了解！
一、历代作品
当然，《合金装备》系列的作品远不止这几作游戏，本人只是拣选了比较有代表性的几作。为了能让有兴趣的玩家更加深入的了解这个系列的一些内容，我按照自己的想法收录一些系列的正版游戏、限定主机和简单周边介绍等等内容，旨在让有兴趣的玩家能够更加充分的了解一些系列的内容。
1. METAL GEAR《合金装备》
系列的开山之作，最初于1987年在日本和欧洲地区的MSX平台发售。故事讲述特种兵SNAKE潜入世外天国，摧毁武器METAL GEAR。METAL GEAR是最早的潜入类型游戏之一。2004年，作了些细微改动后此作被移植到手机平台。
2.METAL GEAR《合金装备》
METAL GEAR在FC/NES平台的“重制版”，日本方面于1987年发售，北美和欧洲于1988年发售。由于过度修改，已经偏离原作的风格，小岛秀夫已经多次坦言对这个版本的不快。
3.METAL GEAR SNAKE’S REVENGE《合金装备：斯内克的复仇》
1990年在北美和欧洲的NES平台发售，是KONAMI美国分部制作的，被做成NES版METAL GEAR的结局。在原来俯视视角基础上增加了横向卷轴场景。而角色和情节在以后的系列游戏中也没有作出解释，并且完全背离了合金装备系列的内涵，小岛秀夫并不承认此作，一般玩家也认为此作不是正统的METAL GEAR。
4.METAL GEAR 2 SOLID SNAKE《合金装备2：固蛇》
最初于1990年在日本地区的MSX2平台发售。讲述SNAKE前往中亚小国ZANZIBARLAND解救被绑架的生物学家。本作主要改进了敌人的AI，故事开始变得扑朔迷离。本作实际上是MSX版METAL GEAR的正统续作。2004年，作了些细微改动后被移植到手机平台。
5.METAL GEAR SOLID《合金装备 索利德》
PS1版的《合金装备》，本人从这个作开始真正接触该系列，相信很多老玩家都是从这个时候开始入坑的！
6.METAL GEAR SOLID INTEGRAL《合金装备索利德： 实体》（完全版）
基于PS1版的加强版，个人记得初版是两张碟，这个是三张碟！
7.METAL GEAR SOLID VR MISSION《合金装备索利德：特别行动》
这个应该是完全版的第三张碟单独出来贩卖，个人是没见过这个单独版本，应该是比较的稀少吧！
8.METAL GEAR GHOST BABLE《合金装备：幽灵通天塔》
GBC的掌机游戏，曾经朋友有过一张正版，当时怎么玩都忘记了，反正以当时GBC的机能，个人觉得还是很惊艳的！
9.METAL GEAR SOLID 2 SONS OF LIBERTY《合金装备索利德2：自由之子》
PS2一代经典之作，朋友为了这张正版两个月没好好吃饭（苦B高中生不容易啊！）
10.METAL GEAR SOLID 2 SUBSTANCE《合金装备索利德2：实体》
实体，个人绝得算是2的加强版，追加了超过700个VR任务关和5个以SNAKE为主角的平行剧本，比较遗憾的是至今我都没玩过，确实是惭愧啊！
11.METAL GEAR SOLID THE TWIN SNAKES《合金装备索利德：孪蛇》
NGC版的《合金装备 孪蛇》，利用2代的引擎重新制作的1代游戏，本人认为比较经典的一作，这个也是本人收藏的第一张《合金装备》系列正版。鉴于种种原因，限定版的主机没有收到，只是收了一个同颜色的普通版银色主机，算是比较大的一个遗憾！限定版主机还带了一张初代的重制版，不知道玩过的朋友有木有说明一下的?
12.METAL GEAR SOLID 3 SNAKE EATER《合金装备索利德3：食蛇者》
《合金装备3》的版本非常多，至少本人百度了一下就有不少，我找了几个大家看一下！
13.METAL GEAR AC!D《合金装备AC!D》
2004年在PSP平台发售。它不是传统的动作游戏，而是卡片战斗的回合制游戏。个人觉得兴趣不大，不知道玩过的朋友觉得如何?
14.METAL GEAR SOLID 3 SUBSISTENCE《合金装备索利德3：生存》
又见完全版（加强版）。
《合金装备索利德3：食蛇者》的加强版，2005年于日本，2006年于北美和欧洲发售。剧情模式加入了自由视角，加入了多人模式和古典METAL GEAR的复刻版。
15.METAL GEAR AC!D 2《合金装备AC!D 2》
卡片2，这个都能出续作，还是有真FANS啊！
16.METAL GEAR SOLID PORTABLE OPS《合金装备索利德：掌上行动》
PSP的正统作品，中间的剧情采用漫画的形式，个人觉得比较赞！同样有限定版的主机！
17.METAL GEAR SOLID PORTABLE OPS+《合金装备索利德：掌上行动+》
又是加强版啊！小岛你碉堡了！
18.合金装备20周年纪念
下面这张图可是我自己的，这个20周年纪念的套装我收了，现在貌似也不贵，里面有初代的重制，还有1.2.3和OPS的游戏，算是一个简单的收藏，有兴趣的玩家可以搜一下看看！
19.METAL GEAR SOLID 4 GUNS OF THE PATRIOTS《合金装备索利德4：爱国者之枪》
合金装备4，从这时开始，转战到了PS3平台，目前也是小岛唯一承诺没有噼腿其他平台的一作！同样也有限定版主机，所谓的钢版主机，现在售价比较高！
20.METAL GEAR ONLINE《合金装备ONLINE》
合金装备系列第一款真正意义上的网战作品，个人感觉制作的还不错，可惜目前已经停服，还没体验过的玩家没有机会了！
21.METAL GEAR SOLID PEACE WALKER《合金装备索利德：和平行者》
个人觉得是PSP上素质最高的一作，同样拥有限定版主机，这个目前收藏量应该不小！
22.METAL GEAR SOLID PEACE WALKER HD EDITION《合金装备索利德：和平行者高清重制》
果然不出所料，时隔不长时间，小岛组便在PS3和XBOX360平台上重制了PSP版的《和平行者》，所谓的HD版！
23.METAL GEAR SOLID HD EDITION《合金装备：高清收藏集》
依然是炒冷饭的作品，合金装备2和3的重制版，分别在PS3、XBOX360和PSV上推出，个人感觉此时的小岛已经“节操”尽失了，有木有?
24.METAL GEAR SOLID SNAKE EATER《合金装备索利德3：食蛇者3D》
这个小岛组可能是考虑到广大任饭的情绪在3DS平台逆移植了《合金装备3》。游戏我在3DS平台玩过试玩版，3D的效果不错，画面什么的我觉着和PS2比基本没什么优势，再加上按键的缺少，我认为本作素质不高！
25.METAL GEAR RISING REVENGEANCE《合金装备崛起：复仇》
外传性质的作品，主角是合金2的雷电！游戏的类型已经不是潜入谍报类，而是硬派的动作游戏，砍杀很过瘾，但是作为系列的FANS，个人不是很喜欢这一作！
26.Metal Gear Solid：The Legacy Collection《合金装备：遗产收藏合集》
合集游戏，收录作品：MG1 MG2, MGS1, MGS1国际版，MGS2HD, MGS3HD, MGS4, MGSPWHD, 合金装备1，2数字漫画。算是目前价格最低的一个全系列收集作品，我觉得想要系列全部回顾一下，这个合集可以考虑！
27.Metal Gear Solid V:GROUNDZERO《合金装备5：原爆点》
《合金装备5： 原爆点》！作为《幻痛》的序章，被曝只有2个小时的流程，不知道这样的有料试玩版玩家们会不会全部买账?至少目前欧洲部分地区已经调低了之前的售价，足见这次小岛的奶粉钱赚的也不是那么顺风顺水。话说，小岛你学谁不好，非要学山内一典的《GT赛车》系列还搞个序章，话说人家是“改了又改5”，你这个有那么吊吗?
除了以上所列的诸多作品外，《合金装备》系列还曾经在安卓和IOS平台推出过三四款手游作品，鉴于作品的影响力和平台设定，本文没有列出，感兴趣的玩家可以自行搜索相关的内容！
二、作者及重要角色
作者简介：
小岛秀夫，大家应该都不陌生，作为《合金装备》系列的设计师，应该算是整个游戏的灵魂人物！小岛秀夫1963年8月24日出生于日本东京都世田谷区，是日本着名游戏设计师，日本KONAMI（科乐美）数字娱乐行政人员、创意主任，开发团队小岛制作（小岛プロダクション）总指挥。
很多人都知道小岛秀夫因主导开发了游戏界第一款战术谍报动作游戏《合金装备》系列而名声大噪，成为全世界最知名的日本游戏制作人之一。其实，除了《合金装备》系列，小岛还参与制作了《我们的太阳》、《ZOE》等知名系列。现在作为科乐美的王牌制作人，已经算是公司的招牌人物了！
《合金装备》系列发展至今，算上系列的正统作品和一些复刻、重制以及衍生作品，共有30多款，算是一个比较庞大的系列群。但是究其最有影响力的作品还是PS1平台的《合金装备》、PS2平台的《合金装备2 自由之子》《合金装备3 食蛇者》以及PS3平台的《合金装备4 爱国者之枪》。
本人是从PS1时代的《合金装备》才开始接触这个系列的，虽然纵观整个系列入坑年代较晚，但也就是从这时开始，系列开始走向整个发展的上升道路，算是黄金期。了解系列的玩家都应该知道，游戏的发售是以1.2.3.4的顺序，但是游戏的主线剧情安排却不是1.2.3.4这样。
1.THE BOSS
二战中率领其组建的眼镜蛇特种部队参加了诸如诺曼底登陆等重大战役，加速了二战的结束，并在二战后期参加了美国在内华达沙漠中的核试验，并遭受到核辐射，二战后在英国特种空勤团和美国的绿色贝雷帽特种部队服役，后来被BIG BOSS所杀，是真正的一名悲剧爱国者！（相关作品：《合金装备3 食蛇者》）
2.BIG BOSS/Naked Snake
代号为Naked Snake，本名JOHN(约翰），部队代号为JACK。美国特殊部队Fox Unit成员，曾参与“Operation Snake Eater”，阻止了在美苏之间的大战，并杀死了“传说中的士兵”The Boss，而得到Big Boss的称号。（相关作品：《合金装备3》、《合金装备 原爆点》、《合金装备 掌上行动》、《合金装备 和平行者》）
3.Solid Snake/OLD SNAKE
代号Solid Snake，本名David（大卫），是Big Boss的克隆人之一，是显性基因克隆体，因诞生的唯一目的是战争，为避免被敌人夺取基因密码，魔童计划之中被修改DNA排序使得没有生育能力，寿命也远比自然人短暂，因此MGS4中身体细胞会急速老化。前Foxhound成员，IQ达180，能操流利六国语言。（相关作品：《合金装备》、《合金装备2》、《合金装备4》）
4.Liquid Snake
代号Liquid Snake，是Big Boss的克隆人之一，是隐性基因克隆体，Solid Snake的双胞胎兄弟。Shadow Moses事件中Foxhound的指挥官，计划失败后死于FoxDie病毒诱发的心肌梗塞。此后,其右臂被移植到Ocelot身上，Liquid的意识竟然也“寄生”到了Ocelot体内。在mgs2中Liquid的意识复苏后就占据了主导地位以致在mgs4中Ocelot也变成了Liquid Ocelot。（相关作品：《合金装备》、《合金装备4》）
5.Otacon
Hal Emmerich ArmsTech的开发人员，Metal Gear Rex的开发者之一。（相关作品：《合金装备》、《合金装备2》、《合金装备4》）
6.Raiden
《Metal Gear Solid2: Sons of Liberty》“Plant篇”主角，Raiden（雷电）是其行动代号，本名不详，Rosemary叫他Jack（杰克）。其父母被Solidus Snake所杀，Solidus Snake将其收为养子。
7.Ocelot
俗称左轮，是眼睛蛇小队的头领、Snake的老师，The Boss和The sorrow的孩子。《合金装备2》中Liquid Snake的右臂移植其身上，一定程度对其思想进行控制，游戏中重要的角色，身份亦正亦邪，贯穿游戏系列的多部作品！（相关作品：《合金装备》、《合金装备2》、《合金装备3》、《合金装备4》）
三、剧情
按时间大致发展顺序：
背景时间段1——
20世纪初，“贤者”zuzhi成立，后筹集了一笔数额庞大的资金，“贤者们的遗产”。
1942年8月，美国陆军技术总部曼哈顿计划开始，宅代(Otacon)的祖父被安排参与此计划，实验却使得自己的儿子也就是宅代的父亲休伊(Huey)双腿残废。同年传说中的战士「先驱者」(The Boss)成立眼镜蛇(Cobra）部队，1947年该部队解散。
1950年，杰克(Jack)也就是后来的"Big Boss"成为"The Boss"的学生。
1960年索科洛夫博士在OKB-754研究所开始进行代号为“Shagohod”的研究。
1962年，古巴导弹危机发生。 The Boss在Tselinoyarsk的任务中被迫杀死她过去的情人The Sorrow。
《合金装备3 食蛇者》剧情（PS2平台 发售日：2004年11月17日（美国）、 12月16日（日本））
CIA为应付冷战时期的形势需要，组建一支以单独潜入手段完成特殊任务的作战部队，该部队命名为FOX小队。表面上作为该部队的实战试验，FOX参与贞洁行动。
1964年8月24日贞洁行动开始。作为FOX小队的一员，化名为裸蛇(Naked Snake)的Jack在汤姆上校(Major Tom)指挥下潜入Tselinoyarsk救援索可洛夫(Sokolov)。索可洛夫是苏联的科学家，研发了名为Shagohod的秘密武器却害怕它的力量，打算转投美国。蛇在行动中初次认识山猫(Ocelot)。蛇救出了索可洛夫，撤退途中索可洛夫却被头目(The Boss)抢去，蛇不敌被推下悬崖。眼镜蛇(Cobra)小队成员重聚，作为移动的导弹发射装置开发出来的Shagohod被沃尔金上校(Volgin)用直升机运走，沃尔金却以头目送来的无后座力核弹发射装置发射了一枚美国制核弹以致事态变得严重。
8月30日食蛇者行动开始，汤姆上校代号改为零(Zero)。蛇再次潜入Tselinoyarsk，任务是救援索可洛夫，摧毁Shagohod，并消灭眼镜蛇小队、沃尔金上校和头目。蛇结识了中国派来的特务艾娃(Eva)，以及后来登场的Metal Gear的发明者葛拉宁(Granin)。蛇从事件中了解到“贤者们的遗产”的存在，沃尔金想要拿到这笔钱。经过一番波折，蛇打败了眼镜蛇小队，消灭了Shagohod和沃尔金，并在最后决战中杀死了恩师头目。任务结束后，艾娃离开了他，留下的信件告诉他整个事件其实是“贤者们”在幕后操纵，头目不过是任务中发生意外，美国和苏联方面双方谈判决定牺牲她以证明美国清白。蛇受到**嘉奖获得「大头目」(Big Boss)称号，却决定退隐离开FOX小队。
Sokolov被Fox小队的Gene救回美国，同时带上了Granin的Metal Gear设计图。 Gene获得了部分“贤者们的遗产”。 CIA获得Metal Gear设计图后命令Sokolov开发新型武器，命名为Metal Gear。 1970年代，苏联和美国的冷战军备竞争导致双方军费大增，双方签署和平协议并开始裁减军备。 CIA害怕苏联裁减军备后军力削弱会加快冷战结束而导致自己地位下降，打算将Metal Gear送给苏联以维护军事均衡。另一方面五角大楼由于CIA的地位巩固以及战略上的一些小动作感到不满，希望削弱CIA，便设计引发事端。
《合金装备 掌上行动》剧情（PSP平台 发售日期：2007年9月20日（日版））
1970年11月2日，Big Boss被叛变的FOX小队抓获并囚禁在San Hieronymo Peninsula（实际上是五角大楼的计划），结识罗伊坎贝尔Roy Campbell。得知FOX小队被指派到此执行任务，却叛变并获得了**的秘密武器Metal Gear。其首领Gene是所谓的“successor”(继承者)计划的产物，目的在于培养头目的继承者领导士兵。大头目俘虏美国及苏联士兵，组建自己的部队。行动中认识了Elisa，NULL(也就是后来的Gray Fox )等人。 Elisa是贞洁行动中核弹爆炸的受害者，因此十分憎恨核弹，但同时又是一个双重性格的人，并有预知未来的能力。 Elisa的另一人格驾驶Metal Gear RAXA攻击Big Boss，被Big Boss击毁。
Gene却说这不过是试验品，引发士兵**后逃去。 Big Boss潜入导弹井，从敌人口中得知这次事件是CIA以及他们背后的“贤者们”策划的。在最后的控制室里，Gene打算启动Metal Gear(ICBMG)时被之前被认为已经死去了的Elisa阻止，Gene杀了她然后用备用开关启动了Metal Gear。最终Big Boss打败了Gene，Gene把用于建立“Army Heaven”的财产的胶卷交给了Big Boss，相信他日后会用到（后用于建设Outer Heaven）。但是ICBMG的启动无法停止，Big Boss与士兵一起攻击火箭，令火箭发生故障偏离航道，ICBMG在大气层中销毁。 Big Boss回国，Zero也解散了Fox。
1971年，基于Fox特种部队的行动特点，大头目成立猎狐犬(Fox Hound)部队。同年，大头目在**河内救出艾娃。
零和山猫铲除了美国方面的“贤者们”势力，利用部分“贤者们的遗产”成立了“爱国者”（The Patriots）zuzhi，以实践头目的理念。在山猫的极力推荐下大头目被引荐进入爱国者，其余的成员还有艾娃、技官(Sigint)、医官(Para-Medic)。但大头目的理念和零日渐产生分歧。 1972年，零执行“恐怖的孩子们计划”(Les Enfants Terribles/恐るべき子供达计画)，目的是制造一个大头目的代替品，固蛇(Solid Snake)和液蛇(Liquid Snake)即是这个计划的产物（但是大首领的完美克隆体中相蛇(Solidus Snake)却并不是这个计划的产物），固蛇和液蛇的母亲是Eva。 “恐怖的孩子计划”加深了大头目和零的矛盾，大头目脱离“爱国者”，以他所理解的“头目的理念”建立起“无国界军队”。零在大头目离开后，变得对一切都感到怀疑，不再相信别人。
《合金装备 和平行者》剧情（PSP平台 发售日期：2010年4月29日（日版）2010年6月30日（美版））
1974年，冷战因美苏两国的力量平衡而暂时平静下来。带领其组建的“无国界军队”驻扎在哥伦比亚的大头目和米勒，迎来了两位客人：自称是哥斯达黎加国联和平大学教授，代表**前来谈判的盖尔维兹(Ramón Gálvez Mena)， ;以及名为帕姿(Paz Ortega Andrade)的学生。盖尔维兹以类似＂头目＂(The Boss)声音的录音为引诱，让Big Boss答应帮助他驱逐驻扎在哥斯达黎加的CIA资助的部队。
蛇从FSLN的阿曼达和奇可口中得知敌人基地的位置及其中的“守护神”。潜入基地的蛇遇上名为寇曼(Coldman)的CIA长官，以及二足步行兵器的开发者休伊(Huey)博士。休伊告诉蛇他开发的PeaceWalker是由AI控制的可移动核威胁力量，最大特点是可移动性以及完全理性的判断。但是PeaceWalker还有AI部分未完成。
在帕姿的朋友西赛儿(Cécile Cosina Caminades)的指引下，蛇找到了AI的开发者奇爱博士(Dr.Strangelove)以及“头目”---由奇爱博士开发，参照头目的人格思考制造出的AI。一番恶斗后AI再次逃脱，Big Boss追踪AI至PeaceWalker的工场被抓住。后来他逃出来却发现PeaceWalker已经完成，未能击败PeaceWalker并让寇曼带着人质帕姿和PeaceWalker逃跑出国。
Big Boss为阻止核弹发射来到尼加拉瓜的美军基地，发现这里被苏联军队控制着。站在他面前的寇曼声称将会给PeaceWalker输入假资料，让它误以为苏联发射核弹然后对苏联展开“反击”。盖尔维兹这时候突然出现，原来他实际的名字是Vladimir Alexandrovich Zadornov，是KGB的间谍;他假意投降CIA，利用美国的技术开发PeaceWalker然后据为己有。盖尔维兹命令帕姿射死寇曼，但帕姿并不愿意这样做。
盖尔维兹打伤寇曼，打算利用寇曼输入指令，将目标改为古巴，让全世界以为美国主动攻击共产主义国家并借机控制中美洲。 FSLN和无国界军队及时赶到将敌人一网打尽。被俘虏的寇曼临死前启动了PeaceWalker，将假资料发送到美军司令部让美国误以为苏联发射核弹，然后让忠于任务的PeaceWalker发动反攻。 Big Boss击败了PeaceWalker却无法阻止其资料传送。这时模拟头目的AI作出了**的决定，控制PeaceWalker走向大海以阻止信号传送。
回到无国界军队基地的蛇，多次出动将逃亡的盖尔维兹抓回，最后发现原来这是为了让帕姿将Metal Gear Zeke改造成可以手动驾驶所制造的空档;而后帕姿驾驶Metal Gear Zeke想要毁灭无国境军队，说出自己其实是「CIPHER」派来的间谍，姓名、身分通通是伪造的;之后与蛇展开了战斗，最后帕姿战败坠海。
零利用奇爱博士的AI技术开发出“爱国者”的AI系统，并逐渐渗透控制世界经济、政治、军事等领域。大头目回到了美国，当上了猎狐犬(Fox Hound)的主管并暗中策划世外桃源计划(Outer Heaven)。
背景时间段2——
某年，Grey Fox收养了一个在战争中失去亲人的小女孩，也就是后来的Naomi Hunter。
1990年，为SAS工作的Liquid Snake在伊拉克执行摧毁移动的飞毛腿导弹发射器的任务，后宣称在任务中失踪。
1994年，Liquid Snake返回美国。
1995年，佣兵团建立的军事zuzhi“Outer Heaven”逐渐浮出水面，美国方面收到情报，“Outer Heaven”正在生产一种能改变世界战局的武器。 Fox Hound负责潜入任务的特工Grey Fox在探索任务中失去联络，在Big Boss指挥下Fox Hound成员Solid Snake负责继续追查该事件，在基地中发现代号为Metal Gear TX-55的武器并发现幕后主脑正是Big Boss。最后他击败Big Boss，炸毁了Metal Gear TX-55并逃出“Outer Heaven”。
1997年，**发生军事叛乱，Zanzibar立国
1999年，Kio Marv博士发明了炼制高度纯净的天然石油的微生物“OILIX”，却被Zanzibar绑架。 Solid Snake在Fox Hound指挥官Roy Campbell的指挥下潜入Zanzibar，却发现Zanzibar的领导者竟然是失踪了的Grey Fox。最后他打败了Grey Fox，Metal Gear D和曾被认为在前次事件中被击败的Big Boss。任务结束后Solid Snake退休居住在阿拉斯加。 Big Boss成为植物人，被Zero“保管”起来。 （在潜龙谍影4出品之前，Big Boss被设定为已死，尸体被保存起来）。 Gray Fox则被救回，身体被改造为忍者。
2000年，Liquid Snake加入Fox Hound，成为地面作战分队的首领。 Naomi Hunter加入Fox Hound的医疗小组，并开始了在士兵身上的DNA理论研究和实验。
《合金装备1 索利德》剧情（PS1平台 发售日期：1998年）
2002年，开发中的Metal Gear Gander，于南美进行演习时被由叛乱将军Augustine Eguabon指挥的Gindra Liberation Front（简称Gilif）抢走，开发人员被绑架并带回Gindra，也就是以前的Outer heaven。在Roy Campbell指挥下，Snake潜入该基地，途中从幸存的Delta Force队员姬丝.珍纳（Chris Jenners）得知潜入部队已全部死亡，而叛乱的美军特种部队Black Chambers也在基地，首领是Viper 。
Snake救出开发者Jimmy Wizard，得知Metal Gear已经装上了核弹。 Viper威胁美国**如果不放弃进攻就会用核弹攻击美国的任一城市。 Snake炸毁发电站打算阻止轨道炮发射，却被告知核弹依然可以发射，Jimmy Wizard也被炸死。 Snake潜入地下一百层，终于找到Metal Gear。这时Viper现身，告诉Snake：Black Chambers叛乱的原因是不想一直做Fox Hound的影子，希望能够帮CIA夺回Metal Gear争回面子。
打败Viper后Snake救回姬丝，姬丝告诉他她是陆军参谋长柏加下命令来的，目的是杀死将军和抹去一切和“Project Babel”相关的人和物。这时将军驾驶Metal Gear Gander出现，告诉他们一切都是自己的安排。 Snake打败将军，将军临时前告诉他真相：Outer Heaven是美国**暗中援助的要塞国家，非正式地提供反美军事力量。当年Big Boss失控，美国将Outer Heaven推翻。后来Outer Heaven成了Gilif，美国想要让非洲出现反美势力，借战争派遣部队进驻，以维持冷战后美国的全球布局。
这就是Project Bable。将军和陆军参谋长都是负责人。这时Viper再次出现并打算发射核弹，原来Metal Gear还是太空中装有核弹的卫星的指挥站。幕后的间谍Brian也被查出。最终Snake击败Viper，阻止了核弹的发射。
2003年，Dr.Clark（即Para-Medic，FOX-HOUND的医疗组长）死于想要逃跑的Gray Fox制造的实验室爆炸中。 Naomi Hunter掩盖了事实并接手Dr.Clark的工作。
2005年2月底，Shadow Moses岛上做演习的Metal Gear被叛乱的Fox Hound队员夺走，借以勒索美国**。 Solid Snake再次被召回执行任务。 Snake潜入基地，认识了Otacon和Campbell的侄女（实际上是女儿）Meryl。
他发现军方秘密开发的是Metal Gear的最新型号REX。作为叛乱的主脑，Liquid Snake打算利用Metal Gear威胁**交出赎金和Big Boss以研究解决自己DNA缺陷的方法。 Snake途中遇上成了改造忍者的Grey Fox，Meryl则在战斗中被敌人俘虏。 Snake后来也被俘获，后被Grey Fox救出。
Snake潜入地下基地，Grey Fox牺牲自己帮助Snake击败REX，Liquid也被Snake打败（这里有两种结局，救出Otacon或者救出Meryl）。 Liquid在最后的追击战中死于Fox-die，其手臂后来被移植到Ocelot的断臂上。而Fox Hound也被遣散。
背景时间段3——
2005年3月：George Sears（Solidus）辞去了美国总统的职务，他被James Johnson取代（实情是他被迫辞职，身体被改造）。
2006年，Solid Snake和Otacon组成了NGO“Philanthropy”，目的是阻止Metal Gear的生产及发展。
2007年4月30日：Jack（Raiden）和Rose第一次见面。 8月8日,USS Discovery事件（曼哈顿外海油轮沉没事件）发生。当时Snake打算潜入油轮获得新的Metal Gear Ray的情报并公之于世，但途中苏联佣兵团进入油轮打算抢回Ray，爱国者派来的Ocelot趁机开枪打死佣兵团团长并夺走了Ray，并将事件责任嫁祸给Snake。油轮在战斗中沉没，对外公开消息指Snake已死。
2008年4月，特种部队DeadCell的成员Chinaman和Old Boy在意外中身亡（根据访谈，这两个角色原本设定为游戏潜龙谍影2里出现，后戏份被删，其技能也延续到其他角色如Vamp身上）。
《合金装备2 自由之子》剧情（PS2平台 发售日期：2001年11月14日（美国）、 2001年11月29日（日本）、 2002年3月8日（欧洲））
2009年：在名义上负责清理曼哈顿外海上沉没的油轮造成的油污而建成的Big Shell工场里，总统James Johnson被恐怖分子，也就是原来的特殊部队DeadCell成员挟持，Raiden作为“Fox Hound”的成员前去营救总统，再遇被认为在2年前已经死去的Snake。
在任务中他发现恐怖分子的目的并不在于赎金，而是工场下面的超级武器“Asenal Gear”。在总统James Johnson的“强迫”下死于Raiden枪下。 Otacon随同Snake营救他的妹妹Emma，一方面是因为她有阻止Asenal Gear的电脑病毒，另一方面是出于个人感情。
Raiden途中遇到恐怖分子首领Solidus，他自称自己的计划叫“自由之子”。后来Emma被杀，Snake通过“俘虏”Raiden得以潜入Asenal Gear，并和Raiden一起杀出一条血路。 Raiden击败了数台Metal Gear Ray，最终不敌。
这时候Emma的病毒生效，Asenal Gear停止运作。在场人员被Ocelot告知所有一切都不过是“爱国者”背后操纵的一场演习。 Asenal Gear撞向纽约，Raiden在华盛顿纪念堂屋顶上打败Solidus。
之后Raiden从“爱国者”手上救出Olga的女儿Sunny，交由Snake和Otacon收养。 Rose被释放，和Raiden一起生活，但Raiden得知自己的儿子流产了（实际上是Rose故意隐瞒）后整日酗酒，Rose离开Raiden改嫁Roy，由他帮忙保护Raiden的儿子。
《合金装备4 爱国者之枪》剧情（PS3平台 发售日期：2008年6月12日）
20XX年(据考证可能是2014年)：战争已经转由专业的PMC(私人雇佣军)参与，PMC全部安装以Nano machine组成“SOP系统”（Sons of the Patriots，以Big Shell事件收集的数据构建的系统），以降低战争成本及控制士兵情感。
Liquid Ocelot组建了最大的雇佣军zuzhi，并策划完全控制“爱国者”AI系统。另一方面，Snake由于基因缺陷出现早衰，却决定再次投入阻止Liquid的战斗中。 Snake在战场上重遇Naomi、Meryl以及改造成忍者身体的Raiden。
通过重重波折，Snake找到了自己的亲生母亲Eva，得知“爱国者”的真相，却亲眼看着她死去。 Liquid得手控制了“爱国者”的部分机能。 Naomi以出卖Snake等人为代价，在Liquid那里获得消灭“爱国者”的办法，最终放弃Nano machine的保护死去。
Snake潜入Outer Haven，用电脑病毒破坏了“爱国者”AI系统。最后从Liquid口中得知他其实就是Ocelot，只不过是用药物及心理暗示扮成Liquid Snake。他本来的目的就是打算破坏“爱国者”建立新的世界体制。
Snake与Liquid Ocelot决战，将其击败。 Snake在墓园遇见通过手术复生的Big boss以及还在世的Major Zero，两人与Snake对话后死去。意识到自己不久于人世的Snake决定和Otancon环游世界。
总结
其实《合金装备》系列的剧情远不止这几作，据本人不完全统计，《合金装备》系列的作品多达30款左右，从本文最初介绍的MSX平台到如今的PS4、XONE，期间横跨了数十个主机平台，不少作品的剧情都相互联系。
因为本文旨在给玩家一个简单且明朗的事件始末，参考作品的关注度，优先选择了这几款作品进行说明，加之本人水平有限，难免有不足之处，还请各位看官见谅！
