游戏延续系列中架空历史的设定，在其中融入了众多真实的人文地理风貌，有独特的星蕴系统、成就系统、镜花水月系统、书信系统等辅助系统。相对于前作，古剑二有着重大的变革：战斗由回合制变为即时制。