游戏结构细节上，《神鬼寓言3》允许玩家决定国民的命运乃至生死，所有裁决将由玩家来做出。另外一个新要素名为“动态触觉”，让玩家可以与别人握手、拥抱、亲吻等形式来进行更丰富的互动。